Till Nötö kommer du med TLO:s Skärgårdsbuss från Åbo, via Pargas, till Pärnäs. Från större städer finns det bra förbindelser till Åbo. Från Pärnäs går förbindelsebåten m/s Utö (se Utö ruttområde i färjtidtabellen) ut till Nötö. Bussresan tar 1 h och 40 minuter från Åbo och båtresan ca 1,5 h.
Du kan också ta din egen bil och parkera den på parkeringsplatsen i Pärnäs medan du besöker Nötö. Du bör dock reservera tid för ev. färjköer, särskilt på fredag- och helgeftermiddagar.